关元穴有温肾壮阳、培补元气的功效，具有治疗泌尿、生殖器疾病的作用，如遗尿、尿血、尿频、尿潴留、尿道痛；痛经、闭经、遗精、阳痿等。此外，对神经衰弱、失眠等也有疗效。
通常可采用针刺法、艾灸法、拔罐法，还可进行自我按摩，如以关元为圆心用左或右手掌做逆时针及顺时针方向摩动3-5分钟，然后随呼吸按压关元穴3分钟，有助于缓解症状。